DNA Fragment Purification Kit MagExtractor® -PCR & Gel Clean up-
使用说明书 (Code No. : NPK – 601) TOYOBO CO. , LTD.Biochemical Operation Department OSAKAJAPAN —目录— [1] 前言 ........................................................................................... 1 [2] 纯化流程...................................................................................... 2 [3] 试剂盒中所包含的物品................................................................. 3 [4] 试剂盒以外所需要的其他物品...................................................... 3 [5] 回收DNA溶液............................................................................. 4 [6] 回收琼脂糖凝胶........................................................................... 5 [7] 疑难解答...................................................................................... 8
注意: 本试剂盒中所包含的都是研究用试剂。请不要用于诊断,临床等场合。在使用本试剂盒的时候,请严格遵守实验室的基本注意事项,注意安全。由于本试剂盒内含有对人体有害的试剂,所以请务必严格遵守各试剂的相关使用说明书,按要求使用保护罩等防护措施。
[1] 前言 MagExtractor - PCR & Gel Clean up-利用在Chaotropic(盐)试剂存在的情况下,核酸能吸附在硅胶上的特性1),用于手动对DNA片段进行纯化。本试剂盒采用磁硅胶粒子,若使用磁性台架,则能最大限度地减少复杂的离心操作,能够快速地的纯化DNA片段。 1)Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76(2) 615-619(1979) 特征
试剂盒的用途
回收的DNA的用途
[2] 纯化流程 下图显示为使用MagExtractor-PCR & Gel Clean up-时的纯化流程。
[3] 试剂盒中所包含的物品
本试剂盒中包含以下试剂。(200次份)
*吸附液,洗净液在低温情况下会析出结晶。请一边用手捂暖,一边 将其倒转混合让结晶溶解后使用。另外,吸附液及洗净液内含有蛋白 变性剂。在使用时务必注意,万一沾到身体,请立刻用清水冲洗。
[4] 试剂盒以外所需要的其他物品
1.试剂 ·灭菌蒸馏水<溶出液> ·75%乙醇<洗净用>
2.器具,器材 ·1.5ml小型试管用磁性台架 ·简易台式离心机 ·漩涡混合器 ·Heat Block 55℃(用于在需要去除混于回收液中的乙醇的场合)
*可使用本公司的磁性台架Magical Trapper(Code No.:MGS-101)等产品。
[5] 回收DNA溶液 2.操作程序 DNA溶液(100μl)1) ↓← 400μl吸附液 ↓← 30μl磁珠2) ↓不时用漩涡混合器搅拌,并放置约1~2min(室温) B/F(固/液)分离3) ↓←(600μl洗净液)4) ↓漩涡混合器搅拌10sec, B/F分离。3) ↓←1ml75%乙醇4) ↓漩涡混合器搅拌10sec, B/F分离。3) 瞬时高速离心,彻底去除上清部分。 (打开小型试管的盖子,55℃下放置5min,干燥)4) ↓←25~100μl蒸馏水 ↓漩涡混合器搅拌10sec, (在无法充分将粒子分离的情况下,请用pipetting来分离粒子。) ↓放置2min B/F分离,回收上清液。5)
1)请尽量不要含矿物油。 2)使用磁珠前,请彻底悬浊混合后再使用。 3)将试管放置在磁性台架上,把磁珠挪近磁石,用微量移液器持续去除 上清部分。通过乙醇清洗时,可以通过将上清液倒入其他容器进行去除。 B/F分离时推荐使用对应于微型试管的磁性台架,但也可用简易台式离心机,用大约6,000r.p.m程度,5sec.的离心进行分离。g会根据离心机的转子口径而发生变化,所以请调整旋转数,使得能更有效地集合粒子,并保证凝结不至于过度。 4)请参照3.的表。 5)回收液中少量混入的磁珠并不会有碍下一次的反应,但在测定吸附度 等场合时,请通过瞬时高速离心除去磁珠。
3.关于工序的省略,纯化规模 ·洗净工序,加热工序可以省略(请参照下表)
·根据DNA溶液的量,可以按比例减少本试剂盒中附带的吸附液、洗净 液和磁珠的使用量。此时,无需减少75%乙醇溶液的使用量。
[6] 回收琼脂糖凝胶 1.前言 ·本操作程序适用于从TAE或者TBE琼脂糖凝胶(约0.3g)中回收 DNA片段。本操作程序是以琼脂糖浓度2%以下的凝胶为对象。 要使用2%以上的凝胶时,推荐所使用凝胶的量少于0.3g。另外,本 操作程序不需要使用特殊的低融点琼脂糖凝胶。 ·能够回收的DNA大小约为100bp~50kbp。 ·回收后的DNA主要用于连接反应、标记、测序等反应。
2.操作程序 琼脂糖凝胶电泳,溴化乙锭染色。 ↓ 在UV照射下(Long wave),为了使得目标条带尽可能地变小,使 用切割刀或手术刀等进行切开。 ↓ 把切开的琼脂糖切细,放到1.5ml小型试管中。(此时称得重量,如 果大于0.3g则分几次进行。)1) ↓←400μl吸附液 在凝胶完全溶解之前,将其放置在室温中,并不时进行搅拌。2) ↓←30μl磁珠3) ↓经常用漩涡混合器搅拌,并放置2min(室温), B/F分离。4) ↓←600μl洗净液 ↓漩涡混合器搅拌10sec, B/F分离。4) ↓←1ml75%乙醇溶液5) ↓漩涡混合器搅拌10sec, B/F分离。4) 瞬时高速离心,彻底去除上清部分。 (打开微型试管的盖子,55℃下放置5min,干燥)5)
↓←25~100μl蒸馏水 ↓漩涡混合器搅拌10sec (在无法充分分开粒子的情况下,请用pipetting来分散粒子。) ↓放置2min B/F分离,回收上清液6)
1) 将琼脂糖凝胶制成切片,以利于溶解。 2) 如果想要快速溶解琼脂糖凝胶或凝胶难以溶解时,请加温至55℃ 5min。 3) 使用磁珠前,请彻底混合后再使用。 4) 将试管放置在磁性台架上,把磁珠挪近磁石,用微量移液器持续去 除上清部分。要洗净乙醇,也可以通过将上清液倒入其他容器来去除。 B/F分离时推荐使用对应于微型试管的磁性台架,但也可使用简易台式离心机,用大约6,000r.p.m程度,5sec.的离心进行分离。g会根据离心机的转子口径而发生变化,故请调整旋转数,使得更有效地集合粒子,并保证凝结不至于过度。 5) 请参照3.的表。 6) 回收液中混入少量磁珠并不会有碍下一次的反应,但在测定吸附 度等场合时,请通过瞬时高速离心除去磁珠。
3.关于工序的省略,纯化规模 ·洗净工序,加热工序可以省略(请参照下表)
*从琼脂糖凝胶中回收核酸时,必须用洗净液清洗。
·根据DNA溶液的量,可以按比例减少本试剂盒中附带的吸附液、洗净 液和磁珠的使用量。此时,无需减少75%乙醇溶液的使用量。
[7] 疑难解答 1.回收量低
2.回收的核酸的吸光度不准确
3.回收后的核酸不能良好地进行反应
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||






