| 1.标记DNA探针 每次标准的反应可标记10ng至3μg线性的DNA,也可标记更大量的DNA,但所有的成分和体积要相应增加。 (1)DNA探针热变性,煮沸10min,迅速冷却于冰/乙醇中5min以上,待用。 (2)取Eppendorf管(1.5ml)置于冰上,加下列及试剂: 新鲜变性的DNA 1-3μg 六聚核苷酸混合物 2μl(管5) dNTP标记用混合底物 2μl(管6) 加无菌重蒸水至 19μl DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow) 1μl(管7) (3)在37℃保温至少60min,可到20h。 (4)煮沸5min,终止反应。 (5)15000rpm离心30s,置于冰上待用。 2.预杂交 按100cm2膜用20~40ml预杂交溶液,预杂交时使溶液处于流动状态。 预杂交液组成:5×SSC 0.5%(W/V)封阻试剂(管11) 0.1%(W/V)N-十二烷酰肌氨酸钠 0.02%(W/V)SDS 膜放入塑料袋,灌入预杂交液,排除气体后密封,在65℃预杂交过夜。 3.杂交 按100cm2膜用2.5ml杂交液,杂交时偶尔摇动杂交袋,使里面的溶液重新分配。 杂交液组成: 50%甲酰胺(V/V) 5%(W/V)封阻试剂 5×SSC 0.1(W/V)N-十二烷酰肌氨酸钠 0.02%(W/V)SDS 新变性标记DNA(150ng/ml) 杂交液取代预杂交液,替换间膜不能干,成功地替换应是膜与塑料袋间形成一层杂交液膜。于42℃杂交过夜(16~20h)。 4.洗膜 按100cm2膜用250ml洗膜液计算。 (1)在室温下用2×SSC/0.1%(W/V)SDS溶液漂洗,5min,2次。 (2)在65℃条件下用0.1×SSC/0.1%SDS溶液漂洗,10min,2次。 (3)在室温下用2×SSC溶液漂洗1次。 5.免疫测定 (1)配制溶液 缓冲液1:Tris-HCl(100mmol/L);NaCl(150mmol/L)pH7.5(20℃) 缓冲液2:0.5%(W/V)封阻试剂(管11),配制于缓冲液1中(封阻试剂不会快速溶解,因此应预早1h前配制此溶液,将试剂溶于50~70℃,此溶液保持混浊)。 缓冲液3:Tris-HCI(100mmol/L);NaCI(100mmol/L);MgCI2(500mmol/L)pH9.5(20℃)。 缓冲液4:Tris-HCl(10mmol/l);EDTA(1mmol/L);pH8.0(20℃) 显色溶液:新鲜配制,在10ml缓冲液3中,加45μlNBT溶液(管9)和35μlX-磷酸盐缓冲液(管10)。 2. 显色过程 A.膜在缓冲液1中短暂洗涤(1min)。 B.在100ml缓冲2中保温30min。 C.再用缓冲液1短暂洗涤。 D.用缓冲液1稀释的抗体结合物(管8)至150U/L(1:5000);稀释后的抗体结合物在4℃只能稳定12h。 E.膜在20ml稀释的抗体结合物溶液中保温30min。 F.用100ml缓冲液1洗膜,以除去未结合的抗体结合物,15min,2次。 G.膜在缓冲液3中平衡2min。 H.在黑暗条件下,膜与10ml显色溶液放入塑料袋内密封或放入合适的盒子内,几分钟内开始出现颜色,一般显色反应在1天后全部完成。当颜色显影时,不可振荡或搅拌。 I.当要求的点或带已被检测时,可用50ml缓冲液4洗膜5min终止反应。 J.摄相。 说明:上述各反应均在室温下进行,除了显色反应外,均需振荡或搅拌。 (五)排除实验中问题的方法 1.DNA不能有效地被标记时考虑 (1)用酚/氯仿抽提和/或乙醇沉淀,重新纯化DNA。 (2)标记反应的保温时间延长(增至20h)。 (3)DNA变性或许不完全,这时对大片段DNA特别重要。 2.不能达到预期的灵敏度时考虑 (1)DNA标记率。 (2)增加标记DNA的浓度或增加杂交时间。 (3)显色反应的时间可延长至3d。 3.若显色时背景过深,可采取 (1)在杂交溶液中减少标记DNA量。 (2)增加杂交溶液的体积,使膜随意漂浮在溶液中。 (3)某些类型的尼龙膜可能产生深色背景,因此可采用其它类型的尼龙膜或改用硝酸纤维素膜。 (4)在杂交和检测过程中增加封阻试剂的浓度。 |